Édubase – Exploiter un tableur pour analyser des données épidémiologiques liant tabagisme et cancer (gène p53)
Résumé de l’article
Qui : Équipe SVT de l’Académie d’Aix-Marseille via Édubase.
Quoi : Une activité propose d’utiliser un tableur pour extraire et traiter un tableau de mutations du gène p53 contenant, pour chaque individu, la nature de la tumeur et des facteurs (fumeur, HPV, soleil…) afin de mener une étude « cas-témoins » et d’en discuter les résultats de façon critique.
Où : France, plateforme Édubase (Académie d’Aix-Marseille).
Quand : Ressource mise à jour le 2 novembre 2025.
Pourquoi : Développer des compétences SVT et CRCN (informations et données, traitement et création), apprendre à relier données et santé (tabac–cancer) et exercer l’esprit critique.
Niveau et public cible
Exemple : CM2 – Élèves (cycle 3) / Collégiens / Citoyens débutants EMI
Objectifs pédagogiques
- Comprendre : comment un tableur permet d’extraire et comparer des données épidémiologiques (gène p53 : nature de la tumeur, statut fumeur, HPV, exposition solaire) pour réaliser une étude « cas-témoins » sur le lien tabagisme–cancer.
- Identifier : les pièges d’interprétation (corrélation ≠ causalité, biais d’échantillonnage, facteurs de confusion comme HPV/soleil) lors de la lecture de résultats.
- Vérifier : une information similaire en reproduisant des tris/croisements dans un tableur, en justifiant les étapes et en comparant avec des sources scientifiques reconnues.
Contenu du cours
« Le tableau des mutations du gène p53 fournit, entre autres, pour chaque individu la nature de la tumeur et des données épidémiologiques (fumeur, HPV, soleil…). Cela permet de réaliser une étude épidémiologique dite de “cas-témoins” et de la discuter (esprit critique). »
[Cours pédagogique : partir de l’exemple concret de l’activité Édubase (tableau des mutations du gène p53 analysé avec un tableur pour étudier le lien tabac–cancer), puis élargir aux bonnes pratiques EMI : distinguer donnée/affirmation, expliciter la méthode “cas-témoins”, contrôler les facteurs de confusion, présenter les résultats de manière honnête et reproductible.]
- Étape 1 : Extraire avec le tableur les variables utiles (fumeur/non fumeur, nature de la tumeur, HPV, soleil) et nettoyer les données (valeurs manquantes, libellés homogènes).
- Étape 2 : Comparer les groupes “cas” (personnes avec tumeur) et “témoins” (sans tumeur ou autre groupe) : tris, filtres, tableaux croisés, pour observer d’éventuelles associations tabac–cancer.
- Étape 3 : Discuter les limites : corrélation ≠ causalité, rôle possible d’HPV/soleil, taille d’échantillon. Rédiger une conclusion sourcée et transparente.
Mots-clés simplifiés
- Tableur : logiciel pour organiser, calculer et trier des données (ex. feuilles avec lignes/colonnes).
- Étude cas-témoins : méthode qui compare des personnes malades (cas) à des non malades (témoins) pour repérer des différences d’exposition (ex. tabac).
- Facteur de risque : élément qui peut augmenter la probabilité d’une maladie (ex. tabagisme).
Exemples concrets reliés à l’article
- Exemple 1 : Filtrer “fumeur = oui” puis compter la part de tumeurs spécifiques et la comparer à “fumeur = non”.
- Exemple 2 : Créer un tableau croisé “HPV (oui/non) × nature de la tumeur” pour vérifier si un autre facteur explique une partie des résultats.
- Exemple 3 : Visualiser dans le tableur (tableau simple) les proportions par groupes et rédiger 3 lignes de conclusion distinguant observation et interprétation.
Quiz interactif EMI
Réponds puis clique pour vérifier :
Fiche synthétique
- Point clé 1 : Un tableur sert à extraire et comparer des données épidémiologiques (gène p53) pour étudier le lien tabagisme–cancer en “cas-témoins”.
- Point clé 2 : Les facteurs (fumeur, HPV, soleil) doivent être pris en compte pour éviter des conclusions hâtives.
- Point clé 3 : En EMI, distinguer corrélation et causalité et expliciter la méthode et les limites augmente la fiabilité de l’information.
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